为了准确地进行基因表达量分析,必须满足只有cDNA作为模板检出的先决条件,但Total RNA中常常混有基因组DNA,并可以直接作为PCR反应的模板进行扩增,因此会造成解析结果不准确。为了避免这种情况发生,通常将检测用引物设计在内含子前后的外显子上,使基因组DNA得不到扩增。但是,此方法不适合具有单个外显子的基因或两个外显子之间所跨的内含子过小的基因,同时当基因组上有伪基因存在时、或设计引物对基因组有非特异性扩增时、以及基因信息没被完全解析的生物种等也同样不适合于本方法。在这种情况下,我们常常需要对Total RNA样品进行DNase I处理,以除去残存的基因组DNA。而DNase I处理通常要进行复杂的纯化操作,同时会造成RNA的降解和损失。
PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser是可以除去基因组DNA进行Real Time RT-PCR反应的专用反转录试剂。Kit中使用了具有较强DNA分解活性的gDNA Eraser,通过42℃,2 min即可除去基因组DNA。同时由于反转录试剂中含有抑制DNA分解酶活性的组分,经过gDNA Eraser处理后的样品可以直接进行15 min的反转录反应合成cDNA,因此,20 min内即可迅速完成从基因组DNA去除到cDNA合成的全过程。
使用本制品合成的cDNA适用于SYBR® Green分析法和TaqMan®探针分析法,可以根据实验目的,选择与SYBR® Premix Ex Taq II (Tli RNaseH Plus)、Premix Ex Taq (Probe qPCR) 等定量试剂组合使用。
注意:Takara Bio使用SYBR® Green I 作为研究试剂已得到Molecular Probes Inc.的许可。SYBR®为 Molecular Probes Inc.的注册商标。
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■ 保存 |
-20℃。
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■ 试剂盒特长 |
1. 含有去除基因组DNA的gDNA Eraser,只需2 min即可除去基因组DNA。
2. 只需15 min即可高效合成Real Time PCR反应用模板cDNA,是进行2 Step Real Time RT-PCR反应的******试剂。
3. 反转录引物使用了Random 6 mers和Oligo dT Primer混合的RT Primer Mix,可以均匀合成样品中的各种cDNA。
4. 本制品提供了SYBR Green®分析法和TaqMan®探针分析法各自最适反应体系,可以根据分析方法选择体系。
(1) 反转录反应中RT Primer Mix的用量。
(2) 反转录反应中总RNA的用量。
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5. Real Time RT PCR定量需要建立标准曲线,建立标准曲线的条件就是需要将总RNA和反转录cDNA稀释到较低的浓度。如果用 |
水或TE Buffer稀释时,由于模板浓度低不稳定,因而会缩小曲线范围,结果精度降低。本制品中附加了标准曲线制作用稀释液 |
EASY Dilution (for Real Time PCR) ,将Total RNA或cDNA稀释至低浓度时也能够进行准确稀释,容易在宽广范围内获得准确 |
定量的标准曲线。 |
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■ 注意事项 |
1. 当同时需要进行数次反应时,应先配制各种试剂的混合液 (Master Mix;其中包括RNase Free dH2O、Buffer、酶等),然后再
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分装到每个反应管中。这样可使所取的试剂体积更准确,减少试剂损失,避免重复分取同一试剂。同时也可以减少实验操作或 |
实验之间产生的误差。 |
2. gDNA Eraser和PrimeScript® RT Enzyme Mix I 在使用前要小心地离心收集到反应管底部。由于酶保存液中含有50%的甘油, |
粘度高,分取时应慢慢吸取。同时,要使用精确、量程适合的移液枪,并且不要使Tip插入液面过深,否则会因Tip壁粘着造成 |
损失,而使酶量不足。 |
3. 5×gDNA Eraser Buffer和5×PrimeScript Buffer 2 (for Real Time) 在使用前需Vortex轻轻离心。
4. 分装试剂时务必使用新的枪头 (Tip),以防止样品间污染。 |